El virus Ébola es un Filovirus de morfología variable, cuyos viriones presentan formas filamentosas de gran longitud (14000nm) pero con un diámetro bastante uniforme (80nm).
Su información genética está almacenada en forma de una única molécula de ARN monocatenario lineal de polaridad negativa, que codifica para 7 proteínas estructurales que conforman el virión.
El virión, por su parte, está constituido por un nucleoide proteico de morfología tubular
A su vez, el nucleoide presenta 2 tipos de proteínas: proteína NP (estructural) y proteína L (ARN polimerasa)। Mientras que la cápside está constituida por varias proteínas: proteína P, VP30, VP35, VP24 y VP40.
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